Точність онкологічних даних: ліцензування, деідентифікація та анотація для інноваційної моделі NLP
Революція в лікуванні раку за допомогою передових технологій НЛП.
Огляд проекту
Клієнту, великому гравцеві в галузі охорони здоров’я, потрібне передове рішення NLP для обробки значного обсягу онкологічних медичних записів. У рамках ключової ініціативи з удосконалення онкологічних досліджень потреба збалансувати детальний аналіз даних із суворими стандартами конфіденційності є першочерговою. У цьому прикладі описано наш внесок у покращення дослідницьких зусиль клієнта за допомогою високоточних анотацій даних, суворої практики деідентифікації та застосування методів обробки природної мови (NLP), і все це в рамках нормативної бази, передбаченої HIPAA.
Основна статистика
Ліцензування даних
+ Де-ідентифікатор даних
10,000 сторінки
Без онкології
сфера
10,000 сторінки
Онкологія
сфера
10,000 сторінки
Онкологія
Відносини
4500 сторінки
Заперечення
9000 сторінки
NER + Відносини
Карт
1223 сторінки
Виклики
Проект вимагав тонкого розуміння клінічної документації, точної ідентифікації медичних установ і здатності точно застосовувати мітки заперечення, і все це в безпечній системі, яка захищає конфіденційність пацієнтів відповідно до правил HIPAA. Ця спроба вимагала не лише технічного досвіду в роботі з великими обсягами складних даних, але й стратегічного підходу до включення зворотного зв’язку та підтримки якості на всіх етапах процесу анотації.
Детальний опис послуг:
- Всебічне охоплення клінічних даних: Охоплюючи різні типи нотаток, налаштування догляду та онкологічні підспеціальності, забезпечуючи надійний набір даних, що відображає різноманітні клінічні сценарії.
- Сувора деідентифікація: Забезпечення деідентифікації всіх позначених записів відповідно до методу безпечної гавані HIPAA, що гарантує клієнту впевненість у конфіденційності та безпеці даних.
- Правила анотації: Створення та впровадження стандартних рекомендацій щодо анотації даних для підготовки маркованих записів відповідно до стандартів HIPAA.
- Розширені методи анотації: Застосування НЛП до 10,000 XNUMX сторінок записів, пов’язаних з онкологією, включаючи складне маркування статусів заперечення та інших відповідних деталей згідно з попередньо встановленими рекомендаціями.
- Ретельний контроль якості: Досягніть стандарту якості, зазначеного в настанові.
Рішення
Наш підхід включав такі ключові стратегії:
Повне охоплення клінічних даних
Щоб пристосувати набір даних до конкретних потреб клієнта, цільовий вибір даних був ретельно витягнутий із обширного репозиторію Shaip, що містить понад 5 мільйонів електронних медичних записів. Цей підібраний набір даних охоплював різні типи нотаток і параметри догляду, забезпечуючи насичений і різноманітний вміст
спектр клінічних сценаріїв. Це забезпечує набір даних, який є не тільки вичерпним, але й дуже репрезентативним для реальних медичних даних.
Сувора деідентифікація
Процес суворо дотримувався методу безпечної гавані HIPAA для деідентифікації, що гарантує впевненість клієнта в конфіденційності та безпеці даних. Це передбачає видалення всієї захищеної медичної інформації (PHI) і заміну її позначеними заповнювачами, таким чином зберігаючи корисність даних, захищаючи конфіденційність пацієнта.
Деідентифікація змінних
| Категорія | Підкатегорія |
|---|---|
| ІМ'Я | Ім’я пацієнта, Ім’я лікаря, Ім’я медсестри, Ім’я члена сім’ї, Назва медичного центру, Назва клініки, Назва будинку престарілих, Назва компанії, Назва університету |
| вік | |
| Дата | Дата, місяць, рік, день, місяць, день, рік, день, місяць, рік, сезон |
| Місце проведення | Країна, штат, місто, вулиця, поштовий індекс, номер кімнати, номер квартири, номер поверху |
| ID | Номер соціального страхування, номер медичної карти, номер бенефіціара плану медичного обслуговування, номер рахунку, номер сертифіката/ліцензії, біометричний ідентифікатор, ідентифікатор запису, номер доступу, ідентифікаційний номер транспортного засобу, номерний знак, ідентифікатори пристрою та серійний номер |
| Контакти | Номер телефону, номер факсу, адреса електронної пошти, веб-URL, IP-адреса |
приклад:
25 вересня 2106 року об 11:00 пан Гаррі Пейс, віком 90 років, був госпіталізований до загальної лікарні Форреста для планової операції на стегні, попередньо проконсультувався з його лікарем доктором Хосе Мартіном і під наглядом Кендри Рейт. MD. Під час його перебування він перебував під опікою Мері Ху, штат Пенсільванія, і Сьюзан Рей, штат Пенсільванія, а також консультувався Р. Чарльз Меланкон, Пенсільванія. Його операція, проведена в той же день, що й госпіталізатор, пройшла успішно, без ускладнень. Після операції пана Пейса перевели до кімнати 202, поверх 2, для відновлення. Його дружина, Емма Пейс, була присутня на заході та отримала всі необхідні оновлення. Під час його короткого перебування його медичні записи, включаючи MRN MR99062619 і рахунок KV000014764, оброблялися відповідно до стандартних протоколів будинку престарілих Грейсвуд, його попереднього місця проживання. Того ж дня його виписали до амбулаторної клініки Окленда для подальшого відновлення. Протягом усього процесу всі процедури були задокументовані та забезпечені дотриманням стандартів конфіденційності.
Приклад: деідентифікований
On [Зразок дати], об 11:00 год. [Ім'я пацієнта], у віці [Вік], був прийнятий до [Назва медичного центру] на планову операцію на стегновому суглобі, попередньо проконсультувавшись зі своїм лікарем первинної медичної допомоги Dr. [Ім'я лікаря], і взяли участь [Ім'я лікаря] MD. Під час перебування він перебував під опікою [Медсестра], НП, і [Медсестра], РН, с [Ім'я лікаря], PA, також консультуються. Його операція, проведена в той же день, що й госпіталізатор, пройшла успішно, без ускладнень. Після операції Mr. [Ім'я пацієнта] було переведено до кімнати № [номер кімнати], Поверх № [Номер поверху], для відновлення. Його дружина, [Ім’я члена сім’ї], була присутня всюди та була забезпечена всіма необхідними оновленнями. Під час його короткого перебування, його медична документація, включаючи MRN [Номер медичної карти] і обліковий запис [номер рахунку], оброблялися відповідно до стандартних протоколів [Назва будинку престарілих], його попереднє місце проживання. Того ж дня його виписали під опіку [Назва клініки] для подальшого одужання. Протягом усього процесу всі процедури були задокументовані та забезпечені дотриманням стандартів конфіденційності.
Інструкції з анотування та розширені методи анотування
Шайп відіграв важливу роль у створенні та впровадженні стандартних інструкцій щодо анотації даних, які гарантували, що всі записи з мітками готувалися послідовно та відповідно до стандартів HIPAA. Крім того, 10,000 XNUMX сторінок з різних медичних записів були ретельно анотовані, с
акцент на детальному маркуванні статусів заперечення та інших клінічно значущих об’єктів, включаючи різні субспеціальності онкології. Анотацію здійснила команда експертів-анотаторів зі спеціальними знаннями в онкології та правилах конфіденційності даних.
Комплексна анотація
| Категорія | Підкатегорія |
|---|---|
| Дата Анотація (онкологія) | Дата діагностики, дата стадії, початок, дата процедури, дата початку медичного лікування, дата закінчення медичного лікування, Дата початку опромінення, дата закінчення опромінення |
| Захворювання (онкологія) | Проблема раку, гістологія, клінічний статус, розташування тіла, поведінка, ступінь, стадія раку, стадія TNM, тест на пухлинний маркер, розміри, код |
| лікування (онкологія) | Ліки проти раку, Дозування препарату, Частота, Хірургія раку, Результат операції, Модальність опромінення, Дозування опромінення |
| Genomics | Код варіації, досліджений ген, метод, зразок |
| Заперечення | Негативний, можливий негативний, невизначений, можливий позитивний |
| Клінічний НЕР Відносини | Проблема раку – Місце на тілі, Гістологія – Місце на тілі, Поведінка – Місце на тілі, Хірургія раку – Місце на тілі, Модальність випромінювання – Місце на тілі, Гістологія – Ступінь, Проблема раку – Вимір |
приклад:
Заява про онкологічну клінічну примітку
«У пацієнтки Джейн Доу 03 діагностовано недрібноклітинний рак легенів (НДРЛ) IIIB стадії, а саме аденокарциному. Ракова пухлина розташована в правій нижній частці легені. Класифікується як T05N2023M3 відповідно до системи визначення стадії TNM, розмір пухлини 2 см х 0 см. Делецію екзону 5 EGFR було ідентифіковано за допомогою ПЛР-аналізу зразка біопсії пухлини. Хіміотерапію карбоплатином AUC 3 і пеметрекседом 19 мг/м² було розпочато 5 р. і її слід застосовувати кожні 500 тижні. З 03 розпочато зовнішню променеву терапію (ЗПТ) в дозі 20 Гр за 2023 фракцій. Лікування пацієнта триває, метастази в мозок на останньому МРТ відсутні. Можливість лімфоваскулярної інвазії ще належить визначити, і толерантність пацієнта до повного режиму хіміотерапії залишається невизначеною.
Онкологічна клінічна примітка:
Ретельний контроль якості
Впроваджено гнучку структуру управління проектами, яка сприяла ефективній інтеграції відгуків клієнтів, дотримуючись суворих стандартів якості. Було впроваджено комплексний протокол забезпечення якості, який узгоджувався з інструкціями для досягнення необхідних стандартів якості. Цей протокол включав послідовні раунди перегляду та перевірки, забезпечуючи точність і надійність анотованих даних. Такий ретельний нагляд за якістю має вирішальне значення для створення надійного рішення НЛП, життєво важливого для прийняття обґрунтованих клінічних рішень і досконалості досліджень.
Результат
Успішно доставлено 10,000 XNUMX високоякісних деідентифікованих позначених записів, забезпечуючи безпечний і цінний набір даних для розробки моделі NLP клієнта. Ретельне застосування NLP і дотримання стандартів деідентифікації HIPAA призвели до високоточного набору даних, який стане основою поточних і майбутніх зусиль клієнта в онкологічних дослідженнях, зрештою спрямованих на покращення результатів лікування онкологічних пацієнтів і ефективність надання медичної допомоги.
Успіх проекту свідчить про нашу здатність точно обробляти складні медичні дані, сприяючи досягненню мети клієнта щодо покращення результатів лікування пацієнтів і прискорення інновацій у сфері охорони здоров’я.
Наше партнерство з Shaip відіграло важливу роль у розвитку наших можливостей НЛП у сфері онкології. Професійна обробка 10,000 XNUMX медичних записів, анотованих детальним запереченням та іншими клінічними об’єктами, продемонструвала їх прагнення до досконалості та відповідності. Більше того, їхня прихильність до стандартів конфіденційності, таких як HIPAA, надала нам безцінні ресурси для просування наших ініціатив штучного інтелекту щодо розробки найсучасніших онкологічних методів лікування та діагностики.
